El gran mito sanitario: "estoy exento de IVA, luego no me afecta VeriFactu"
Es la creencia más extendida y más costosa del sector. La confusión nace de mezclar dos obligaciones completamente distintas:
- La exención de IVA (Art. 20 Ley 37/1992) significa que no debes repercutir IVA en tus facturas de servicios sanitarios. Es una obligación del Impuesto sobre el Valor Añadido.
- VeriFactu (RD 1007/2023) exige que el software que uses para emitir esas facturas genere registros inalterables con hash SHA-256. Es una obligación del sistema de control fiscal antifraude.
El RD 1007/2023 establece con total claridad que la obligación de utilizar un Sistema Informático de Facturación inalterable recae sobre la emisión de la factura en sí misma, independientemente de si el servicio lleva IVA o está exento. Todas tus facturas exentas deben llevar el código QR de Hacienda.
Una clínica con software antiguo se expone a 50.000 € de multa
Si una clínica sigue utilizando un software médico antiguo que permite borrar el historial de cobros o editar facturas emitidas, se expone a la sanción de 50.000 € por ejercicio fiscal (Art. 201 bis LGT), además de invalidar la justificación de sus ingresos ante Hacienda. La fecha límite es el 1 de enero de 2027 para clínicas como sociedad y el 1 de julio de 2027 para profesionales autónomos.
Tipos de IVA en el sector sanitario: exentos vs sujetos
El software de la clínica debe estar programado para gestionar esta dualidad de tipos impositivos en una misma factura o agenda de pacientes:
Servicios exentos
0% IVA
- Consultas médicas y diagnóstico
- Cirugía con fin terapéutico
- Odontología y empastes
- Fisioterapia con prescripción médica
- Psicología clínica
- Análisis clínicos y laboratorio
Servicios sujetos
21% IVA
- Blanqueamiento dental estético
- Medicina estética sin fin terapéutico
- Botox y rellenos estéticos
- Cirugía estética voluntaria
- Nutrición sin prescripción médica
- Venta de productos cosméticos
La leyenda de exención en la factura es obligatoria
En las facturas médicas exentas, además del código QR de VeriFactu, el programa debe incluir automáticamente la mención expresa de la exención. Por ejemplo: para medicina general: "Servicio exento de IVA según el Art. 20. Uno. 3º de la Ley 37/1992". Para dentistas: "Exento de IVA según el artículo 20. Uno. 5º de la Ley del IVA". Esta leyenda debe inyectarla el software de forma automática.
Casuísticas habituales de facturación en clínicas
| Situación | IVA | ¿VeriFactu? | Nota clave |
|---|---|---|---|
| Consulta médica a paciente | 0% Exento | Sí — QR obligatorio | Leyenda exención Art. 20 obligatoria en factura |
| Empaste dental | 0% Exento | Sí — QR obligatorio | Leyenda exención odontológica Art. 20.Uno.5º |
| Blanqueamiento estético | 21% | Sí — QR obligatorio | Tributa al tipo general al ser puramente estético |
| Factura a aseguradora (B2B) | 0% Exento | Sí — QR obligatorio | Igual que paciente particular pero a nombre de la aseguradora |
| Prótesis dental (laboratorio externo) | Variable | Sí — desglose suplidos | Los suplidos (prótesis) deben desglosarse en la factura |
| Psicólogo sin titulación sanitaria | 21% | Sí — QR obligatorio | Sin colegiación médica, el servicio no está exento |
RGPD + VeriFactu: una sola plataforma para todo
El sector sanitario tiene la mayor carga de protección de datos de cualquier actividad profesional. Los datos de salud son datos de categoría especial (nivel alto) bajo el RGPD y la LOPD, lo que exige medidas técnicas muy estrictas: cifrado, control de acceso, registro de actividades y auditoría.
El software elegido no solo debe cumplir con VeriFactu para Hacienda, sino también con Sanidad y con el RGPD. Plataformas líderes en la nube como Clinic Cloud integran la historia clínica del paciente, la receta electrónica y la facturación VeriFactu en un mismo entorno seguro y cifrado, evitando tener que usar dos programas distintos.
En el sector dental, el programa Gesden (con presencia en más de 14.000 clínicas) es el estándar histórico de escritorio. Las clínicas con versiones antiguas de Gesden deberán migrar a Gesden Evo para garantizar que el motor sella criptográficamente las facturas y emite el QR.
Checklist de adaptación para clínicas y consultas
- Verificar que el software gestiona la dualidad IVA: El programa debe permitir facturar el mismo día un tratamiento exento (0%) y uno estético (21%) sin errores, con las leyendas legales correctas en cada caso.
- Confirmar la inyección automática de leyendas de exención: El software debe incluir automáticamente el texto legal de exención en cada factura exenta, referenciando el artículo exacto de la Ley del IVA.
- Verificar la Declaración Responsable VeriFactu del software: Solicitar al proveedor el documento firmado. Especialmente importante en programas de gestión médica clásicos (Gesden versiones antiguas).
- Integrar historia clínica con facturación: Para cumplir el RGPD en datos de salud, usa una plataforma que unifique historia clínica y facturación VeriFactu. Evita tener programas separados con duplicidad de datos de pacientes.
- Configurar la facturación a aseguradoras: Cuando factures a compañías de seguros, el software debe generar la factura B2B con el QR, el hash y los actos médicos desglosados, igual que una factura a particular.
- Desglosar suplidos (prótesis, laboratorio): El paciente tiene derecho a conocer el coste separado de los honorarios del profesional frente a los costes de materiales externos. El software debe permitir este desglose sin romper el encadenamiento del hash.
Software recomendado para clínicas y centros de salud
Para el sector sanitario, necesitas una plataforma que combine gestión clínica (historia clínica, agenda, receta) con facturación VeriFactu y cumplimiento RGPD para datos de salud en un entorno cifrado. Clinic Cloud y Gesden Evo son las soluciones líderes del mercado español. Para consultas pequeñas con pocos pacientes, Contasimple con el plan profesional puede cubrir la facturación básica.
Preguntas frecuentes: clínicas y VeriFactu
Sí, rotundamente. VeriFactu depende de la obligación de emitir factura y usar software para ello, no del tipo de IVA. Todas tus facturas —incluso las emitidas al 0%— deben incluir el código QR de Hacienda y generarse con software homologado.
Sí, si es puramente estético. Los tratamientos sin fin terapéutico ni de salud —como un blanqueamiento estético, medicina estética o cirugía voluntaria de mejora de imagen— tributan al 21% de IVA, a diferencia de los tratamientos dentales con fin de salud (empastes, endodoncias, extracciones) que están exentos.
No. Usar Excel para llevar la facturación de tu consulta médica o dental es una infracción tributaria grave, sancionable con 50.000 € anuales, ya que no permite el encadenamiento de datos ni la inalterabilidad exigida por el RD 1007/2023.
Exactamente igual que a un paciente particular, pero a nivel B2B. El software debe generar una factura a nombre de la compañía de seguros detallando los actos médicos prestados, sellarla con el hash inalterable e imprimir el código QR de VeriFactu.
Fuentes y referencias
- BOE: Ley 37/1992 del IVA — Artículo 20 — Exenciones en operaciones interiores: servicios sanitarios y médicos, odontología.
- BOE: Real Decreto 1007/2023 — La obligación VeriFactu aplica sobre la emisión de la factura independientemente de la exención de IVA.